RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471185.5

NFU1-208, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 1 (best)

Gene NFU1, Length 598 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-208	ENST00000471185	IGF1	P05019	195 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	GNB1	P62873	340 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NFU1-208	ENST00000471185		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	HOXB5	P09067	269 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	FOXL1	Q12952	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185		Q6ZRM9	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OR2B8P	P59922	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	ADAP1	O75689	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	NDP	Q00604	133 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	STPG2	Q8N412	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SSNA1	O43805	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	PITX3	O75364	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SPCS3	P61009	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185		E7EUB6	86 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	IFNA17	P01571	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	SLC35B1	P78383	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	TNC	P24821	2201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185		A0A1W2PN81	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NFU1-208	ENST00000471185	OPN1MW	P04001	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms