RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CEACAM4O75871 244 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 NRASP01111 189 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 KRASP01116 189 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CCL3P10147 92 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 BMP5P22003 454 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF134P52741 427 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 Q0VG73 95 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PIGYQ3MUY2 71 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ST8SIA1Q92185 356 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PROK2Q9HC23 129 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 BET1LQ9NYM9 111 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PSENENQ9NZ42 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CACNA1AO00555 2505 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 DNAJC13O75165 2243 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 A0A0G2JRQ6 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 H0Y980 276 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 SYNGR2O43760 224 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PDCD6O75340 191 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 GPX1P07203 203 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CCL11P51671 97 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 KRTDAPP60985 99 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 BAGE3Q86Y29 109 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 BAGE2Q86Y30 109 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 STHQ8IWL8 128 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 OSR2Q8N2R0 312 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 STARD4Q96DR4 205 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 VPS25Q9BRG1 176 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CSTL1Q9H114 145 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 RNF114Q9Y508 228 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SLC22A20A6NK97 555 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 M0QZ24 198 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 NEURL1O76050 574 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 CTXN2P0C2S0 81 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 C1QTNF9P0C862 333 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 ID1P41134 155 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 MYBPHQ13203 477 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 HIST3H3Q16695 136 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 ACSM6Q6P461 480 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SLC25A22Q9H936 323 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 MGAQ8IWI9 3026 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 MED12Q93074 2177 aa7.27□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 FAM166BA8MTA8 275 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 K7ENP7 123 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SH2D1BO14796 132 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1D-12P01611 117 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 P04436 131 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 IAPPP10997 89 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 TSPOP30536 169 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SPINK14Q6IE38 97 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 Q6ZRM9 215 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 Q6ZS49 121 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 SFRP2Q96HF1 295 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 GTF3C1Q12789 2109 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 C11orf94C9JXX5 98 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 F2Z2F3 143 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 EFNA2O43921 213 aa7.26□□□□□ -1.25
SHQ1-203ENST00000463369 CRYGBP07316 175 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms