RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RRHO14718 337 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF721Q8TF20 911 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RRN3P1Q2M238 152 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CCL8P80075 99 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SPRED2Q7Z698 418 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MANBALQ9NQG1 85 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IGSF23A1L1A6 192 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFA2O43678 99 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SYNGR2O43760 224 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RIGQ13278 110 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KHDC3LQ587J8 217 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 GPR35Q9HC97 309 aa9.94□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 LYRM9A8MSI8 78 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IL4P05112 153 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CCL13Q99616 98 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PRSS50Q9UI38 385 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 M0QXV9 152 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ANK1P16157 1881 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CORTO00230 105 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RUNX1Q01196 453 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PERPQ96FX8 193 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TDGF1P3P51864 188 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KCNMB1Q16558 191 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.93□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RNF222A6NCQ9 220 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 J3QRE1 110 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CTSBP07858 339 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ID3Q02535 119 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 EGR4Q05215 589 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 C16orf92Q96LL3 132 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SNURFLB1AK76 121 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IFI6P09912 130 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM50BP56557 158 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HCP5Q6MZN7 132 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 VAX2Q9UIW0 290 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CLDN14O95500 239 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PILRBQ9UKJ0 227 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MSGN1A6NI15 193 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KNCNA6PVL3 124 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 NAPSAO96009 420 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 REG1AP05451 166 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZP4Q12836 540 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.92□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0J9YW62 118 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 F8WDY8 70 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV3-20P01619 116 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 COX6B1P14854 86 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HSD52Q0P140 79 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WV48 116 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CD69Q07108 199 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF519Q8TB69 540 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TGIF1Q15583 401 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RNF122Q9H9V4 155 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0U1RQV1 116 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 LEAP2Q969E1 77 aa9.91□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RS1O15537 224 aa9.9□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.9□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.9□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 H0YL77 283 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms