RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 YIPF6Q96EC8 236 aa8.69□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 COMMD9Q9P000 198 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 SULT1C2O00338 296 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 UPK2O00526 184 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 TNFSF12O43508 249 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 TNFAIP8O95379 198 aa8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 TAS2R46P59540 309 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 OR2B8PP59922 312 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 HERV-K104P61576 105 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 SSX9Q7RTT3 188 aa8.68□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 GPHA2Q96T91 129 aa8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.68□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 C2orf70A6NJV1 201 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 ZNF785A8K8V0 405 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 OR2C1O95371 312 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 HAGHQ16775 308 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.67□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 CCDC140Q96MF4 163 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 EHFQ9NZC4 300 aa8.67□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 ARL3P36405 182 aa8.66□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 TAS2R20P59543 309 aa8.66□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 TMEM17Q86X19 198 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 OR51H1Q8NH63 302 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.66□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 ATP6V0BQ99437 205 aa8.66□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 HERC2O95714 4834 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.65□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 TPPPO94811 219 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 APOA1P02647 267 aa8.65□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 CLEC3BP05452 202 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 FCER2P06734 321 aa8.65□□□□□ -1.02
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IRF1-204ENST00000439555 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 GPX8Q8TED1 209 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 MARC2Q969Z3 335 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 NEURL2Q9BR09 285 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
IRF1-204ENST00000439555 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.65□□□□□ -1.02
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