RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 EFNA4P52798 201 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 SERF2P84101 59 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 TLE4Q04727 773 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 SEC11CQ9BY50 192 aa14.46□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 NPY1RP25929 384 aa14.45□□□□□ -0.1
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.45□□□□□ -0.1
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ACTB-201ENST00000331789 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.16e-9■■■□□ 16.1
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ACTB-201ENST00000331789 IGKV1-33P01594 117 aa14.45□□□□□ -0.1
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ACTB-201ENST00000331789 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.43□□□□□ -0.1
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ACTB-201ENST00000331789 RPEQ96AT9 228 aa14.43□□□□□ -0.1
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1456Q9P272 454 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 M0R1W7 72 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 CNTFRP26992 372 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.42□□□□□ -0.1
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