RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF212Q495C1 297 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10K2Q6IF99 312 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 PHYHIPQ92561 330 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 NICN1Q9BSH3 213 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 EI24O14681 340 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CD1AP06126 327 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CTXN2P0C2S0 81 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-GP17693 338 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRB1P18505 474 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 GADD45AP24522 165 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ETV1P50549 477 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY14Q15391 338 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX9Q7RTT3 188 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8NAQ8 132 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM80Q96HE8 168 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 GINS3Q9BRX5 216 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 AASSQ9UDR5 926 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 ETV7Q9Y603 341 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T8A6NH00 312 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL12BO14950 172 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SOCS1O15524 211 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP8B1O43520 1251 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CIB2O75838 187 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 YIF1AO95070 293 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 S1PR2O95136 353 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 AREGP15514 252 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB3P16520 340 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL6IP1Q15041 203 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 Q56UQ5 140 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZRM9 215 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPXQ9UHP9 88 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM189A5PLL7 270 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00473A8K010 186 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 EPM2AB3EWF7 344 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 REG1AP05451 166 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPC4P59998 168 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC119Q13432 240 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF11Q5DX21 431 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZR54 194 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB3CQ96E17 227 aa5.7□□□□□ -1.5
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