RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, human

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CA11	O75493	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CDRT1	O95170	752 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CRYGB	P07316	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PSG1	P11464	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	COX4I1	P13073	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	RASSF2	P50749	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TNXA	Q16473	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	S100A13	Q99584	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281		S4R3C0	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1B0GW64	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	GPX5	O75715	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CLEC3B	P05452	202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	GTF2F2	P13984	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SERPINA2	P20848	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	CAPG	P40121	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TFPI2	P48307	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PRKY	O43930	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	RAB3A	P20336	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PSMB6	P28072	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PRSS8	Q16651	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC196-208	ENST00000641281	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SC5D	O75845	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	FGF2	P09038	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	HSD17B1	P14061	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	RPA2	P15927	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TNFSF8	P32971	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CCR9	P51686	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CBX3	Q13185	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	GK3P	Q14409	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	STH	Q8IWL8	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1W2PP11	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281		M0R1X1	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	DHFR	P00374	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	IFNA5	P01569	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms