RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 AREGP15514 252 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GNB3P16520 340 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GADD45AP24522 165 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP1P43487 201 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HES5Q5TA89 166 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A7Q96R45 310 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A9Q9NRM0 540 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB22AQ9UL26 194 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD11O94819 623 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CRHBPP24387 322 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD7P51665 324 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ARFRP1Q13795 201 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF645Q8N7E2 425 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf4Q9NR00 106 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGES3LE9PB15 166 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 REG1AP05451 166 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC3BP05452 202 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CD36P16671 472 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB6P28072 239 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF183Q96D59 192 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 UFC1Q9Y3C8 167 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 E7EUB6 86 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR183P32249 361 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM91Q6ZNR0 172 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4S2Q8NH73 311 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPOQ9BU64 300 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GY05 133 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD2BA6NFX1 497 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB27BO00194 218 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF735P0CB33 412 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HSMCR30P0CW71 290 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MAS1LP35410 378 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL30P62888 115 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf58Q96LI9 332 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH4A6NGS2 130 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MFNGO00587 321 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYGCP07315 174 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX9Q7RTT3 188 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GW64 132 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf88P0DMB2 117 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CTRB1P17538 263 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GALP22466 123 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CTRB2Q6GPI1 263 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PLET1Q6UQ28 207 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL5AQ8N109 375 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GATAD1Q8WUU5 269 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1109Q2LD37 5005 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOD1P15172 320 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAM1Q15629 374 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf66Q9H5L9 145 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL17Q9UF56 701 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA2Q9UM82 520 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ELLP55199 621 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL8P62917 257 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2W1Q9Y3N9 320 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A5O76082 557 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5B3Q8NH48 314 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN4O14817 238 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 RPA2P15927 270 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF3L2Q3SX64 289 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZS49 121 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF502Q8TBZ5 544 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN3BQ9NY72 215 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HRASP01112 189 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DQB1P01920 261 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNA4P05014 189 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-GP17693 338 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT14Q96FL9 552 aa20.22■□□□□ 0.83
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