RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ATG12O94817 140 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 KBTBD11O94819 623 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR2A4O95047 310 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SPDEFO95238 335 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-5P01602 117 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IL5P05113 134 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 AKR1C2P52895 323 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RAG2P55895 527 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35G3Q8N808 338 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TEX45Q8NA69 505 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 COQ8AQ8NI60 647 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IL22RA2Q969J5 263 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SEC22AQ96IW7 307 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM56Q96MV1 263 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR2A7Q96R45 310 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PHB2Q99623 299 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM140Q9NV12 185 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.77□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0B4J293 547 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 AMY1AP04745 511 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CRYBA1P05813 215 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CRYGBP07316 175 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR9G9P0C7N8 305 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GNB1P62873 340 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 BLCAPP62952 87 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 POU2AF1Q16633 256 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TATDN3Q17R31 274 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LRTM2Q8N967 370 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR4A5Q8NH83 315 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MITD1Q8WV92 249 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 BET1LQ9NYM9 111 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NF1P21359 2839 aa6.76□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0B4J2A0 478 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JRQ6 117 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 UPK2O00526 184 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FCN1O00602 326 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SSNA1O43805 119 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ADAP1O75689 374 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SNAPC5O75971 98 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CA2P00918 260 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 HOXB5P09067 269 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 VDAC1P21796 283 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR2B8PP59922 312 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TNXAQ16473 311 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS8Q16651 343 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MMD2Q8IY49 270 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR4A16Q8NH70 328 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GPR146Q96CH1 333 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NSG2Q9Y328 171 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ALG5Q9Y673 324 aa6.75□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CCSO14618 274 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ACTL6BO94805 426 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CNIH1O95406 144 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA21P01568 189 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DRB1P01911 266 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OPN1MWP04001 364 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 P0C879 139 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MYOD1P15172 320 aa6.74□□□□□ -1.33
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