RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZNF738Q8NE65 137 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 MED12Q93074 2177 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 FNDC10F2Z333 226 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 C3orf80F5H4A9 247 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SIRPB1O00241 398 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 ISLRO14498 428 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 IGLV2-8P01709 118 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DQA1P01909 254 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR9G9P0C7N8 305 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 EDDM3BP56851 147 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 APH1AQ96BI3 265 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR8B2Q96RD0 313 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 C12orf77C9JDV5 145 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 J3QW42 95 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OOEPA6NGQ2 149 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 LINC00473A8K010 186 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CCL2P13500 99 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 AMTP48728 403 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 PRR20EP86478 221 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 PRR20CP86479 221 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 PRR20DP86480 221 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 PRR20BP86481 221 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 PRR20AP86496 221 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RAC2P15153 192 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SELENOVP59797 346 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 EFNB3Q15768 340 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 FBLN7Q53RD9 439 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 BET1LQ9NYM9 111 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 GFRA3O60609 400 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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HCG18-242ENST00000602319 VASH2Q86V25 355 aa8.19□□□□□ -1.1
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HCG18-242ENST00000602319 TXN2Q99757 166 aa8.19□□□□□ -1.1
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HCG18-242ENST00000602319 AQP7O14520 342 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 MT-CO2P00403 227 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CA6P23280 308 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF4P23510 183 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 Q8TCH9 128 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 DEPPQ9NTK1 212 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 HNF1AP20823 631 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 IL11RAQ14626 422 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CENPWQ5EE01 88 aa8.18□□□□□ -1.1
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HCG18-242ENST00000602319 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 C2orf70A6NJV1 201 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR2J3O76001 311 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 HBZP02008 142 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR1C1Q15619 314 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 STUMQ69YW2 141 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 HTD2P86397 168 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 VWA1Q6PCB0 445 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-242ENST00000602319 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.18□□□□□ -1.1
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