RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595286.1

TIMM50-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, human

TSL 2

Gene TIMM50, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM50-204	ENST00000595286	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286	BVES	Q8NE79	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM50-204	ENST00000595286		A0A0G2JLM5	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CTDSP2	O14595	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RGS5	O15539	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	LGALS7	P47929	136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CBX3	Q13185	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286		A8MZ25	164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RCVRN	P35243	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RFX2	P48378	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	LCE6A	A0A183	80 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SHOX	O15266	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PMP2	P02689	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	HRH1	P35367	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	BRI3	O95415	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CRYZL1	O95825	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CSN3	P07498	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	HERV-K104	P61576	105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PHB2	Q99623	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	FCGR3B	O75015	233 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	FXYD4	P59646	89 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PRSS8	Q16651	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	HAGH	Q16775	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286		H0Y980	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	PRH1	P02810	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	UBE2K	P61086	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TNXA	Q16473	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	BORCS5	Q969J3	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM50-204	ENST00000595286	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM50-204	ENST00000595286	TBP	P20226	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM50-204	ENST00000595286	GNRHR	P30968	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM50-204	ENST00000595286	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM50-204	ENST00000595286	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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