RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4A47Q6IF82 309 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 DTD1Q8TEA8 209 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SCARB1Q8WTV0 552 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RBKSQ9H477 322 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 USF3Q68DE3 2245 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf61A6NNL5 157 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SULT1A1P50225 295 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2E1P51965 193 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 BAP18Q8IXM2 172 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SIRPDQ9H106 197 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 F8P00451 2351 aa18.37■□□□□ 0.53
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CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00205P59089 165 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX2Q02962 417 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5B3Q8NH48 314 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf1Q9H5F2 150 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL17Q9UF56 701 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MSGN1A6NI15 193 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF3BA8MYP8 253 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 B4DSR2 109 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 UPK2O00526 184 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NXPH3O95157 252 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CD1BP29016 333 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RELBQ01201 579 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD6Q96DN6 1003 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNRD1Q9P1U0 126 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV20A0A0B4J274 112 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM24AA6NFZ4 105 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KBTBD11O94819 623 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA5P01569 189 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR9G9P0C7N8 305 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IAPPP10997 89 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB11AP62491 216 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V1FQ16864 119 aa18.34■□□□□ 0.53
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CAPNS1-212ENST00000591041 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.34■□□□□ 0.53
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CAPNS1-212ENST00000591041 ACTL6BO94805 426 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 F2RL1P55085 397 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A24Q6NUK1 477 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 UBAC2Q8NBM4 344 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MALSU1Q96EH3 234 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM14BQ9NUH8 114 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1-16P04430 117 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MSMBP08118 114 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 BRS3P32247 399 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MAS1LP35410 378 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2B8PP59922 312 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS57Q6UWY2 283 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A32Q9H2D1 315 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ITPR3Q14573 2671 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PN81 502 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNAB3O43448 404 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPAN9O75954 239 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNA7P36544 502 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL8P62917 257 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MMD2Q8IY49 270 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 STPG2Q8N412 459 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LILRB2Q8N423 598 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1456Q9P272 454 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TCF19Q9Y242 345 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CSMD2Q7Z408 3487 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF23A1L1A6 192 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM157AC9JC47 383 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX9P55771 341 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX8Q06710 450 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.3■□□□□ 0.52
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