RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCD2OSQ96PS1 177 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MGLLQ99685 303 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GGTLC1Q9BX51 225 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRKBQ9Y3C4 175 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IFITM5A6NNB3 132 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS10O43665 173 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD11O94819 623 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB6AP20340 208 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2K4P45985 399 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52B4Q8NGK2 314 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPOQ9BU64 300 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF320A2RRD8 509 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MWP6 167 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6G6CO95867 125 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 AREGP15514 252 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CRHBPP24387 322 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 UXS1Q8NBZ7 420 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A7Q96R45 310 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC90BQ9GZT6 254 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A9Q9NRM0 540 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2W1Q9Y3N9 320 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 DPPA5A6NC42 116 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD5O14737 125 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DQB1P01920 261 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF735P0CB33 412 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-13P0DP09 117 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CD36P16671 472 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 DTYMKP23919 212 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P11Q13670 270 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WXM4 84 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYGCP07315 174 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM18P0DKX4 95 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 BRWD1-AS2P59051 145 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX1Q16384 188 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 BTNL8Q6UX41 500 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN14Q8NG11 270 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4S2Q8NH73 311 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM2AQ8TAG5 236 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL21EPA6NDL7 271 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf65A6NEN9 183 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOD1P15172 320 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB6P28072 239 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM106AQ4KMX7 169 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG5Q9H1Y0 275 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CTRB1P17538 263 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK9Q2XQG4 91 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF20Q53R12 229 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CTRB2Q6GPI1 263 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS48Q7RTY5 328 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2C2APQ86WQ0 139 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 BATF3Q9NR55 127 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK9Q9UKQ9 250 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA2Q9UM82 520 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YWU9 116 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD2BA6NFX1 497 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 REG1AP05451 166 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MAS1LP35410 378 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CDNFQ49AH0 187 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF773Q6PK81 442 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CGB1A6NKQ9 187 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A5O76082 557 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CTXN2P0C2S0 81 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3BP20337 219 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL9P24844 172 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD55Q3KP44 614 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A47Q6IF82 309 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX9Q7RTT3 188 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 GPHA2Q96T91 129 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R8Q9NYW2 309 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 DHFRP00374 187 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL6IP1Q15041 203 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HACD4Q5VWC8 232 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD4AQ8N468 514 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM30A4D0T7 59 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NUPR2A6NF83 97 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC3BP05452 202 aa19.09■□□□□ 0.65
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