RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	FXYD4	P59646	89 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RPEL1	Q2QD12	228 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	IFT46	Q9NQC8	304 aa		7.19	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479		H0Y980	276 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SULT1C2	O00338	296 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HPRT1	P00492	218 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RFX2	P48378	723 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TAS2R20	P59543	309 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HERV-K104	P61576	105 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF45	Q02386	682 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CATR1	Q13166	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	NECAP1	Q8NC96	275 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	BORCS5	Q969J3	196 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	BET1L	Q9NYM9	111 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	EHF	Q9NZC4	300 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		7.18	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479		E7EUB6	86 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2J3	O76001	311 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	DHFR	P00374	187 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PMP2	P02689	132 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYGC	P07315	174 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CSN3	P07498	182 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF735	P0CB33	412 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	NQO2	P16083	231 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	GNRHR	P30968	328 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS3	P35030	304 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TAS2R31	P59538	309 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf32	Q32M92	178 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM209B	Q5JX69	171 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4A47	Q6IF82	309 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM17	Q86X19	198 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N1Y9	231 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.17	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	BMPR1B	O00238	502 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFA4	P12838	97 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	HLA-G	P17693	338 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	NAT1	P18440	290 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMB6	P28072	239 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	TAS2R46	P59540	309 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	VBP1	P61758	197 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	LCN12	Q6JVE5	192 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		7.16	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GW64	132 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MZ25	164 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	UPK2	O00526	184 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFB8	O95169	186 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2C1	O95371	312 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	APOA1	P02647	267 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	MYOD1	P15172	320 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	AREG	P15514	252 aa		7.15	□□□□□ -1.26
KIFC3-231	ENST00000567479	CTRB1	P17538	263 aa		7.15	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms