RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TMEM186Q96B77 213 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ATP5SQ99766 215 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 MMP26Q9NRE1 261 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 GAB2Q9UQC2 676 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 IGHV4-39P01824 125 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 APELAP0DMC3 54 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PRRX1P54821 245 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 RPEQ96AT9 228 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PERPQ96FX8 193 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CLCC1Q96S66 551 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 NABP2Q9BQ15 211 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TCF19Q9Y242 345 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 SMCO3A2RU48 225 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.83□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 SPP1P10451 314 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CAMLGP49069 296 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ATP5J2P56134 94 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 NOTCH2Q04721 2471 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RRHO14718 337 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SLC25A17O43808 307 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SPCS3P61009 180 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.83□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.83□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 GINS3Q9BRX5 216 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 REG4Q9BYZ8 158 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ENY2Q9NPA8 101 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C15orf61A6NNL5 157 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 DFFBO76075 338 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGLV1-47P01700 117 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SEC11BP0C7V7 166 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IL3RAP26951 378 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SULT1A2P50226 295 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 LINC00052Q96N35 136 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZANQ9Y493 2812 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 A0A087X0M5 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GX30 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FGF16O43320 207 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SCO1O75880 301 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FSTL3O95633 263 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CNTFRP26992 372 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 TAS2R30P59541 319 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SSX2Q16385 188 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 AUP1Q9Y679 476 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 E7EUB6 86 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OVOL3O00110 214 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR8U8P0C7N1 319 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LINC00311Q8N616 119 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZNF596Q8TC21 504 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C15orf62A8K5M9 175 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 KBTBD11O94819 623 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TSPAN15O95858 294 aa6.81□□□□□ -1.32
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