RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	MMD	Q15546	238 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		Q499Y3	187 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	RASL11A	Q6T310	242 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		Q6ZRU5	148 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SLC25A45	Q8N413	288 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR51H1	Q8NH63	302 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	LRRC29	Q8WV35	223 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SMIM8	Q96KF7	97 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MGLL	Q99685	303 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		Q9H521	79 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SCN3B	Q9NY72	215 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	VWA8	A3KMH1	1905 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DISP2	A7MBM2	1401 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PTPRT	O14522	1441 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NFASC	O94856	1347 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		A0A0G2JRQ6	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		F5H5P2	479 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		H3BP45	60 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		I3L521	148 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PIR	O00625	290 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OVOL1	O14753	267 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	AGPAT2	O15120	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DPM2	O94777	84 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KCNK2	O95069	426 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IGHV4-34	P06331	123 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ADRA2A	P08913	450 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	UCHL1	P09936	223 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CECR9	P0C854	216 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	BCL2	P10415	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CCL1	P22362	96 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ATP6V0C	P27449	155 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR10J1	P30954	320 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CCR2	P41597	374 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	LPAR6	P43657	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	COPZ1	P61923	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CAV1	Q03135	178 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MEST	Q5EB52	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SBSN	Q6UWP8	590 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF695	Q8IW36	515 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	C6orf223	Q8N319	242 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DERL3	Q96Q80	235 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRIB3	Q96RU7	358 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PARP11	Q9NR21	331 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NAT8	Q9UHE5	227 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	HES2	Q9Y543	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	AKAP12	Q02952	1782 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	EEA1	Q15075	1411 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		2.76	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms