RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DPRXA6NFQ7 191 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DOK3Q7L591 496 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TAX1BP3O14907 124 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 VDAC1P21796 283 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CA7P43166 264 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NEUROG1Q92886 237 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PROK2Q9HC23 129 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE12BA1L429 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SLC17A3O00476 420 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF253O75346 499 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB4O95168 129 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 VENTXO95231 258 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN18P56856 261 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GNB1P62873 340 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SERF2P84101 59 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SFRP2Q96HF1 295 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 FCN1O00602 326 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZG16O60844 167 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CCL1P22362 96 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IER3P46695 156 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MPV17L2Q567V2 206 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 A1L4Q6 167 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf94C9JXX5 98 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF83P51522 516 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PCBD1P61457 104 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NIT1Q86X76 327 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM12Q96EX1 92 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PS18 150 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 K7ERU9 68 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 NRASP01111 189 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 KRASP01116 189 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 BMI1P35226 326 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5G3P48201 142 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SRPXP78539 464 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 Q8NA96 180 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 FRYQ5TBA9 3013 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf97H3BN30 126 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SPINK4O60575 86 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.46□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 F5H5K5 113 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CORTO00230 105 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 COX6B1P14854 86 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 MUC15Q8N387 334 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 RNF212BA8MTL3 300 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SNURFLB1AK76 121 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 DHHO43323 396 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CD99P14209 185 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF843Q8N446 348 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 LYZL6O75951 148 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 IGLL1P15814 213 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF90Q03938 601 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 GP6Q9HCN6 339 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 PSENENQ9NZ42 101 aa8.45□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 A0A096LPE4 126 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PPZ6 126 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 CELA3BP08861 270 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 UCP1P25874 307 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 Q0VG73 95 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 NTF3P20783 257 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 KITLGP21583 273 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 PRRX1P54821 245 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-211ENST00000520276 ASCL4Q6XD76 172 aa8.44□□□□□ -1.06
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