RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512028.5

SPDL1-211, Transcript of spindle apparatus coiled-coil protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPDL1, Length 667 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1-211ENST00000512028 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 BAG2O95816 211 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GALP22466 123 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 PRDX6P30041 224 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MNAT1P51948 309 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 PRSS8Q16651 343 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C12orf74Q32Q52 190 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 HARBI1Q96MB7 349 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CELA1Q9UNI1 258 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.71□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C15orf61A6NNL5 157 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 J3QLW9 94 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ITGB1BP1O14713 200 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 FAM107AO95990 144 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CLEC3BP05452 202 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GLAP06280 429 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MIFP14174 115 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MYOD1P15172 320 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF19P17023 458 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 FUT3P21217 361 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CAPGP40121 348 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SOX2P48431 317 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 RNF212Q495C1 297 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DDI2Q5TDH0 399 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C12orf73Q69YU5 71 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DHFR2Q86XF0 187 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SPIN2AQ99865 258 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 RNF213Q63HN8 5207 aa5.7□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DAPL1A0PJW8 107 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 AQP12BA6NM10 295 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TMEM212A6NML5 194 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 M0R1X1 148 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 NPSP0C0P6 89 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CEACAM6P40199 344 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DAPP51397 102 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GPR176Q14439 515 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C6orf223Q8N319 242 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TEX45Q8NA69 505 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 FRZBQ92765 325 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 C4orf36Q96KX1 117 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 BANF2Q9H503 90 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF221Q9UK13 617 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.69□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 HMX3A6NHT5 357 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ACTL6BO94805 426 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GSTT2P0CG29 244 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GSTT2BP0CG30 244 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 RPA2P15927 270 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 PSMB6P28072 239 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 BDKRB2P30411 391 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TFPI2P48307 235 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 UBE2KP61086 200 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MS4A2Q01362 244 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TMED1Q13445 227 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.68□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 E9PI62 339 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 J3QRE1 110 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 PDCD6O75340 191 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 TNFRSF6BO95407 300 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 CD2P06729 351 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 MGMTP16455 207 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 ZBTB25P24278 435 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 NPY1RP25929 384 aa5.67□□□□□ -1.5
SPDL1-211ENST00000512028 GPR183P32249 361 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms