RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00271P0C7V0 271 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DOBP13765 273 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM258P61165 79 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ADIGQ0VDE8 80 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZS49 121 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 PIP4P1Q86T03 277 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 SPACA5Q96QH8 159 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 VAMP8Q9BV40 100 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 MDFICQ9P1T7 246 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 AK3Q9UIJ7 227 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 PCTPQ9UKL6 214 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TTC3P53804 2025 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TNS2Q63HR2 1409 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087X0T9 212 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2L6O14933 153 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 SLC37A4O43826 429 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV4-39P01824 125 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 IFITM1P13164 125 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 SDC2P34741 201 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 DIO3P55073 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF146Q15072 292 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RNF185Q96GF1 192 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TEX37Q96LM6 180 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CKLFQ9UBR5 152 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RARRES3Q9UL19 164 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 NEO1Q92859 1461 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GTL3 188 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 B4DEV8 164 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FFAR1O14842 300 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV12-3P01733 135 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CTSEP14091 401 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CRYBB3P26998 211 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 OPRK1P41145 380 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 AQP4P55087 323 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R19P59542 299 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 CATR1Q13166 79 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 KLRD1Q13241 179 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF141Q15928 474 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 Q5BKY6 102 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF114Q8NC26 417 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RAB37Q96AX2 223 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 NEURL3Q96EH8 262 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 YPEL4Q96NS1 127 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 LINC01587Q99440 93 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 ABCC3O15438 1527 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0J9YXV3 536 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 LY6LH3BQJ8 138 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 RER1O15258 196 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 TRGC2P03986 189 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 PSMB3P49720 205 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 HERVK_113P63121 156 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCD4-211ENST00000498367 HES3Q5TGS1 186 aa5.66□□□□□ -1.5
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