RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRT1	Q99946	306 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EIL1	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26	4e-8	■□□□□ 9.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTL6B	O94805	426 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CNIH1	O95406	144 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF45	Q02386	682 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	BRI3	O95415	125 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	HPRT1	P00492	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CD40LG	P29965	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2K	P61086	200 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424		V9GYH0	126 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V318	75 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BUA1	57 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RLN1	P04808	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	F2R	P25116	425 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-16	P61578	105 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2A4	O95047	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CA2	P00918	260 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	NQO2	P16083	231 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP5C	P53041	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R31	P59538	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	GNB1	P62873	340 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FCN1	O00602	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD3	Q14802	87 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF79	Q15937	498 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOV	Q96L33	236 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPX	A8MT69	81 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG12	O94817	140 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINE2	P07093	398 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	MAS1L	P35410	378 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGP	P57054	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	RND3	P61587	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	NDP	Q00604	133 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PHB2	Q99623	299 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PN81	502 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MPPED1	O15442	326 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX15	O60248	233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGB	P07316	175 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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