RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 OR4A16Q8NH70 328 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 DDB2Q92466 427 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 R3HDM4Q96D70 268 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SEC22AQ96IW7 307 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RAB40CQ96S21 281 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CHIAQ9BZP6 476 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PRNDQ9UKY0 176 aa5.69□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 H7C2Y5 167 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 L7N2F9 121 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TAAR5O14804 337 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SHOXO15266 292 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 KCNAB3O43448 404 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PROP1O75360 226 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PITX3O75364 302 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 VENTXO95231 258 aa5.68□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 NMSQ5H8A3 153 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MOB3BQ86TA1 216 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR1S1Q8NH92 325 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 GPR146Q96CH1 333 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CYYR1Q96J86 154 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 NABP2Q9BQ15 211 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 BET1LQ9NYM9 111 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.68□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM89A2RUT3 159 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MARCH11A6NNE9 402 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 LINC00473A8K010 186 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 H0YJW9 148 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SLC31A2O15432 143 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ADAP1O75689 374 aa5.67□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 UBE2KP61086 200 aa5.67□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 EBI3Q14213 229 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF345Q14585 488 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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SHQ1-207ENST00000475558 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF383Q8NA42 475 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR5B3Q8NH48 314 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 NANPQ8TBE9 248 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SMIM8Q96KF7 97 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR10C1Q96KK4 312 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RHOVQ96L33 236 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 GON7Q9BXV9 100 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ENY2Q9NPA8 101 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MMP26Q9NRE1 261 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 U3KQ87 197 aa5.67□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1W2PPE3 182 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 FAM157AC9JC47 383 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM77I1YAP6 450 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 K7EPK0 472 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 NPFFO15130 113 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SYNGR2O43760 224 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 DEDDO75618 318 aa5.66□□□□□ -1.5
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