RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCN12Q6JVE5 192 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNIH2Q6PI25 160 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPARTQ8N0X7 666 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51E2Q9H255 320 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 S4R3C0 116 aa6.36□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM213A2RRL7 107 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPPED1O15442 326 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFB8O95169 186 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYGCP07315 174 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 AREGP15514 252 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTRB1P17538 263 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TALDO1P37837 337 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RANBP1P43487 201 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIR2DS2P43631 304 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD81P60033 236 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP5G2Q06055 141 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 C15orf32Q32M92 178 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD4AQ8N468 514 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB125Q8N687 156 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NECAP1Q8NC96 275 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPIN2AQ99865 258 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEURL2Q9BR09 285 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEMTQ9UBM1 199 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB26Q9ULW5 256 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA2Q9UM82 520 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.35□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 A8MWP6 167 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGALS9O00182 355 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 AIREO43918 545 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2C1O95371 312 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-23P01764 117 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTXN2P0C2S0 81 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOLR2P14207 255 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD36P16671 472 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPA13P48723 471 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL6IP1Q15041 203 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TATDN3Q17R31 274 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSX9Q7RTT3 188 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAX1Q8IWV1 398 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2A7Q96R45 310 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPOQ9BU64 300 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 PALMDQ9NP74 551 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLXQ9UH92 298 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFSF12O43508 249 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A5O76082 557 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 REG1AP05451 166 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMB9P28065 219 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMB6P28072 239 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDC2P34741 201 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAS1LP35410 378 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNG2P59768 71 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSMO1Q15800 293 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 POU2AF1Q16633 256 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4A47Q6IF82 309 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms