RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PGAM2	P15259	253 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RPA2	P15927	270 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK-16	P61578	105 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SPIN2A	Q99865	258 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PN81	502 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		A6NHS1	94 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MPPED1	O15442	326 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PF4V1	P10720	104 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNA7	P36544	502 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RAB9A	P51151	201 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	GNB1	P62873	340 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RUNX1	Q01196	453 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TNXA	Q16473	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	LFNG	Q8NES3	379 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRX2	142 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	S1PR2	O95136	353 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PIGP	P57054	158 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF45	Q02386	682 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	VSIG4	Q9Y279	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		H0Y980	276 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SOX15	O60248	233 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ATG12	O94817	140 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-G	P17693	338 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MYCNOS	P40205	109 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	LPAR6	P43657	344 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PPP5C	P53041	499 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PHB2	Q99623	299 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	UPK2	O00526	184 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PF4	P02776	101 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINE2	P07093	398 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR9G9	P0C7N8	305 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SSX9	Q7RTT3	188 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	GPR132	Q9UNW8	380 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JLM5	398 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59

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