RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.14□□□□□ -0.31
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC190Q86UF4 302 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4D10Q8NGI6 311 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 COMMD9Q9P000 198 aa13.14□□□□□ -0.31
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.11□□□□□ -0.31
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RABGEF1-204ENST00000442563 FAAP20Q6NZ36 180 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 OR13C8Q8NGS7 320 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM63Q969Q1 353 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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