RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.52□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF212BA8MTL3 300 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLA2G10O15496 165 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF16O43320 207 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFSF12O43508 249 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIR2DS2P43631 304 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LGALS7P47929 136 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CATR1Q13166 79 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HES1Q14469 280 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HNF4GQ14541 408 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTL8BQ17RB0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM177Q53S58 311 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf88Q6PI97 169 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM219Q86XT9 240 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q8N2B8 174 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPBQ8NG41 125 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NBR2O15453 112 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFA3O95167 84 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFA7O95182 113 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDEFO95238 335 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AMY1AP04745 511 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RLN1P04808 185 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGAM2P15259 253 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F2RP25116 425 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 S100GP29377 79 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BTCP35070 178 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIGPP57054 158 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAS2R60P59551 318 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RELBQ01201 579 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MMDQ15546 238 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSX9Q7RTT3 188 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q8N9W7 124 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4S2Q8NH73 311 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RITA1Q96K30 269 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00052Q96N35 136 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPHA2Q96T91 129 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1RLQ9NZP8 487 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR132Q9UNW8 380 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB19A4D1S5 217 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H0Y980 276 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPPED1O15442 326 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCGR3BO75015 233 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFB6O95139 128 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGLV2-23P01705 113 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRYBA1P05813 215 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HKR1P10072 659 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PI3P19957 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC6A1P30531 599 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F2RL1P55085 397 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAP2BP61225 183 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COTL1Q14019 142 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMCO1Q147U7 214 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OPCMLQ14982 345 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSG5Q15238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms