RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407298.7

APOBEC3B-204, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,282 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-204ENST00000407298 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 C2orf70A6NJV1 201 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 LGALS9O00182 355 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 ACTL6BO94805 426 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 FOLR2P14207 255 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR20EP86478 221 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR20CP86479 221 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR20DP86480 221 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR20BP86481 221 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR20AP86496 221 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 DEFA5Q01523 94 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 ARL6IP1Q15041 203 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 NECAP1Q8NC96 275 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 SCGNO76038 276 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 APELAP0DMC3 54 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TALDO1P37837 337 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TNFRSF9Q07011 255 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TNXAQ16473 311 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TMEM177Q53S58 311 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 SPIN2AQ99865 258 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC3B-204ENST00000407298 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 IGLV2-14P01704 120 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 PTHLHP12272 177 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 BMI1P35226 326 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 UBE2KP61086 200 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 NCS1P62166 190 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRSS8Q16651 343 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 GPHB5Q86YW7 130 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 GINS4Q9BRT9 223 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 SPATA2Q9UM82 520 aa9.21□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 A0A0J9YWU9 116 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 LINC00473A8K010 186 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 UBE2CO00762 179 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 CBLN1P23435 193 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 APOC4P55056 127 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 GNG2P59768 71 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 C15orf32Q32M92 178 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR4A47Q6IF82 309 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 Q6ZWC4 215 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 HERC2O95714 4834 aa9.2□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 KMT2AQ03164 3969 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 A0A0A6YYH2 397 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 A6NJ64 397 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 SPRY2O43597 315 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 TMEM127O75204 238 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR2C1O95371 312 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 HLA-DQB1P01920 261 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 CNIH2Q6PI25 160 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 LYG2Q86SG7 212 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.19□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.18□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 ZNF320A2RRD8 509 aa9.18□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 PPP5D1E7EU14 171 aa9.18□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR2J3O76001 311 aa9.18□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRH1P02810 166 aa9.18□□□□□ -0.94
APOBEC3B-204ENST00000407298 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms