RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 OR2B8PP59922 312 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 VAMP2P63027 116 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 ENY2Q9NPA8 101 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 NSG2Q9Y328 171 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRK-201ENST00000368202 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 H3BUX3 64 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 UPK2O00526 184 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RRHO14718 337 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FSHBP01225 129 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FGF2P09038 288 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RAB32Q13637 225 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 EBI3Q14213 229 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PSG5Q15238 335 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 AANATQ16613 207 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MMD2Q8IY49 270 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 AJUBAQ96IF1 538 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C15orf61A6NNL5 157 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SMLR1H3BR10 107 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MPC2O95563 127 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV2-23P01705 113 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C1QBP02746 253 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 P0C879 139 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CNTFRP26992 372 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MAS1LP35410 378 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RELBQ01201 579 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TNXAQ16473 311 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZRM9 215 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 NPBQ8NG41 125 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HYLS1Q96M11 299 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FBXL15Q9H469 300 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM160Q9NX00 188 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 VPS13CQ709C8 3753 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 K7EPK0 472 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SYNGR2O43760 224 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SSSCA1O60232 199 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PITX3O75364 302 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFA3O95167 84 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 LY6G6DO95868 133 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 F2RL1P55085 397 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SPCS3P61009 180 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 GNB1P62873 340 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF9Q07011 255 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CD300CQ08708 224 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF429Q86V71 674 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR5R1Q8NH85 324 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 DCUN1D4Q92564 292 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RITA1Q96K30 269 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HINT2Q9BX68 163 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TCF19Q9Y242 345 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PN81 502 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms