RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1W2PS18 150 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 GFRA3O60609 400 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RAMP3O60896 148 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TSPOP30536 169 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PSG7Q13046 419 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 OR2M7Q8NG81 312 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 C5orf49A4QMS7 147 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 HLA-DQA1P01909 254 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 PPBPP02775 128 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF883P0CG24 379 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 THBS3P49746 956 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 SSPNQ14714 243 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR10D3Q8NH80 312 aa16.02■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 NEURL1O76050 574 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 DEFA4P12838 97 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 EDDM3BP56851 147 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 RPL31P62899 125 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGFBP7Q16270 282 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OSTCQ9NRP0 149 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CEP250Q9BV73 2442 aa16.01■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 SLC17A3O00476 420 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 NXPH2O95156 264 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 C3orf79P0CE67 100 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 GCHFRP30047 84 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 GCSAMLQ5JQS6 135 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 POM121L2Q96KW2 1035 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR2H2O95918 312 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ARR3P36575 388 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 SPATA46Q5T0L3 261 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 NIT1Q86X76 327 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR4P4Q8NGL7 312 aa16■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 SIRPB1O00241 398 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 SH2D1BO14796 132 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF83P51522 516 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CLDN18P56856 261 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 MLF1P58340 268 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR2D2Q9H210 308 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 COX6A1P12074 109 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CD59P13987 128 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CCNOP22674 350 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ERVK11-1P61568 191 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF146Q15072 292 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 STUMQ69YW2 141 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 BORCS7Q96B45 105 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.99■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGHEP01854 428 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 AMY1AP04745 511 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TNFSF4P23510 183 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TREML4Q6UXN2 200 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 GALMQ96C23 342 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CELA2AP08217 269 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 FBLN7Q53RD9 439 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 RASL11AQ6T310 242 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 LYG1Q8N1E2 194 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 OR52E5Q8NH55 327 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 C5orf30Q96GV9 206 aa15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 C17orf98A8MV24 154 aa15.97■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.97■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.97■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.97■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 RRHO14718 337 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 CA2P00918 260 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 MYF5P13349 255 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 MGST2Q99735 147 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 HES4Q9HCC6 221 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 IGLC7A0M8Q6 106 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 PRSS46E5RG02 174 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 AQP7O14520 342 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 PMCHP20382 165 aa15.96■□□□□ 0.15
MVB12A-201ENST00000317040 HNF1AP20823 631 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms