RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 RND2P52198 227 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RRN3P1Q2M238 152 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 F5H697 171 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NPFFO15130 113 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF737O75373 536 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CD74P04233 296 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MELTFP08582 738 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OR10J1P30954 320 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MMP26Q9NRE1 261 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TGOLN2O43493 480 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ORM1P02763 201 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PRB1P04280 392 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TFPI2P48307 235 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ERVFC1-1P60608 527 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 UNC119Q13432 240 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TEX45Q8NA69 505 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF738Q8NE65 137 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GPR146Q96CH1 333 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PAXXQ9BUH6 204 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DLX6P56179 175 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HGFACQ04756 655 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TNFRSF9Q07011 255 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DDB2Q92466 427 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RNF114Q9Y508 228 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 Q8TCH9 128 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 AP1S3Q96PC3 154 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PRR13Q9NZ81 148 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OBSL1O75147 1896 aa6.67□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OR2J3O76001 311 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 COL8A2P25067 703 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MORN2Q502X0 79 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGSF23A1L1A6 192 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 LINC00869P0C866 280 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SPNP16150 400 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C3orf56Q8N813 242 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NEUROG1Q92886 237 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TVP23CQ96ET8 276 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PPP5D1E7EU14 171 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 P2RY4P51582 365 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 BAGE3Q86Y29 109 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 BAGE2Q86Y30 109 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SIAH2O43255 324 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF735P0CB33 412 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZP3P21754 424 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SERF2P84101 59 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DEFA6Q01524 100 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.66□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PSMB11A5LHX3 300 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GATA4P43694 442 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF137PP52743 207 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DLK1P80370 383 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SMIM8Q96KF7 97 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 K7EM74 188 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PLAUP00749 431 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GAFA1Q96PS6 74 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms