RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plekha3Q9ERS4 297 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 P2ry4Q9JJS7 361 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plekhb1Q9QYE9 243 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Malrd1A2AJX4 2123 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr418A0A140T8J6 310 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1329L7MTV4 313 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plscr4P58196 326 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r236Q05A06 334 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q3U595 105 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mtch2Q791V5 303 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr923Q7TRB9 317 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr645Q7TRQ1 315 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Exosc6Q8BTW3 273 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r37Q8R2E4 302 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1269Q8VEZ2 309 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1265Q8VEZ3 309 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dcbld1Q9D4J3 503 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fscn3Q9QXW4 498 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Klri1B2KG20 248 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Defa34D3Z0J0 93 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Psmb1O09061 240 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ear3O35290 156 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nipsnap1O55125 284 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Klk1b3P00756 261 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 P01629 112 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 H2-DMaP28078 261 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 ArsgQ3TYD4 525 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd300lbQ3U497 209 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem184aQ3UFJ6 425 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 ScimpQ3UU41 150 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ceacam14Q78Y72 263 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mtch1Q791T5 389 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cdhr3Q8BL00 831 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rgs13Q8K443 158 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1079Q8VF52 315 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr469Q8VF66 314 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr980Q8VH08 310 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Scgb3a2Q920H1 91 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tdrd6P61407 2134 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21970F6XX07 295 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ascl5M0QWB7 188 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hyal2O35632 473 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mtatp6P00848 226 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 KrasP32883 189 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cox7a2P48771 83 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mcrip1Q3UGS4 97 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plk3Q60806 631 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vma21Q78T54 101 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr494Q8VG07 314 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1238Q8VG59 315 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Shisa5Q9D7I0 235 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 S1pr3Q9Z0U9 378 aa6.6□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm14409A2ARR8 349 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1406E9Q8X1 310 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r67G5E8C1 305 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Evx1P23683 416 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Oas1bQ60856 376 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1183Q8VFF8 303 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr262Q8VFV8 312 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Iqcf5Q9DAL7 148 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr157Q9QZ20 318 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gk2Q9WU65 554 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm14444A2ARW3 426 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm5093E9PZB3 174 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gosr1O88630 250 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Oprk1P33534 380 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr90Q0VEL5 310 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr5Q60889 312 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tspo2Q9CRZ8 162 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ube2v2Q9D2M8 145 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hoga1Q9DCU9 321 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 FetubQ9QXC1 388 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rsg1A2A825 258 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp971A2BFG8 470 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 F2rl1P55086 399 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp970Q08BU3 522 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wfdc8Q4KUS1 273 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr324Q5NCC7 333 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fam214bQ8BR27 538 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Psg16Q8K0U8 395 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hus1bQ8K572 276 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1230Q8VG58 305 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm14412A2ARR7 526 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ms4a18J3QN01 344 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Upk2P38575 184 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ier3P46694 153 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd7P50283 210 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 MidnQ3TPJ7 465 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd96Q3U0X8 602 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 Spata22Q5SV06 358 aa6.59□□□□□ -1.35
Usp40-201ENSMUST00000040783 SnrpcQ62241 159 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.9 ms