RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CLCC1Q96S66 551 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PALMDQ9NP74 551 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF580Q9UK33 172 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 G3V318 75 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 M0QZ24 198 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPAN15O95858 294 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CA2P00918 260 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA6P05013 189 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35B1P78383 322 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CATR1Q13166 79 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR51H1Q8NH63 302 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4S2Q8NH73 311 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GON7Q9BXV9 100 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PARP11Q9NR21 331 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR31O00270 319 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB3DO95716 219 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RLN1P04808 185 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CSF1P09603 554 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF735P0CB33 412 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 VDAC1P21796 283 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 UCP3P55916 312 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2KP61086 200 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N3U1 123 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TEX45Q8NA69 505 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SRRQ9GZT4 340 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FBN3Q75N90 2809 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 UPK1BO75841 260 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHG4P01861 327 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KIR2DS2P43631 304 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TEX38Q6PEX7 206 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 COMMD1Q8N668 190 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TNCP24821 2201 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PRX2 142 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OPN1MWP04001 364 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 AKAIN1P0CW23 69 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMB8P28062 276 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD3Q14802 87 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 MEF2DQ14814 521 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PRSS8Q16651 343 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ECSCRQ19T08 205 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PYDC2Q56P42 97 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N402 240 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TERB2Q8NHR7 220 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ARPC1AQ92747 370 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIM63Q969Q1 353 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RHOVQ96L33 236 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC32Q9BV29 185 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 VWFP04275 2813 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SOX15O60248 233 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 HPRT1P00492 218 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV1-40P01703 118 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms