RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 A8MZ25 164 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 J3QRK9 145 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 MPPED1O15442 326 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 FCGR3BO75015 233 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SCGNO76038 276 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 IGLV2-14P01704 120 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 HLA-DQB1P01920 261 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CTXN2P0C2S0 81 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CD36P16671 472 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CDK10Q15131 360 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RPEL1Q2QD12 228 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TPRA1Q86W33 373 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 MUC7Q8TAX7 377 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ZMAT4Q9H898 229 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 FAM223BA6NKX1 122 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 H0Y980 276 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SSX5O60225 188 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TUSC2O75896 110 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SLC22A5O76082 557 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ACTL6BO94805 426 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 OR2A4O95047 310 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ATP6V1G2O95670 118 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 PRH1P02810 166 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CSN3P07498 182 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 GNG2P59768 71 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RHOGP84095 191 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ZNF45Q02386 682 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CASC10Q5T4H9 136 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 CNIH2Q6PI25 160 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 MMD2Q8IY49 270 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SPIN2AQ99865 258 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SSR3Q9UNL2 185 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 BMPR1BO00238 502 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 KBTBD11O94819 623 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SDC2P34741 201 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SCAND1P57086 179 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TATDN3Q17R31 274 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 LCN12Q6JVE5 192 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 ZNF773Q6PK81 442 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 OR4S2Q8NH73 311 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SNAPC3Q92966 411 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 OR51E2Q9H255 320 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 Q9H521 79 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 TENM2Q9NT68 2774 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-247ENST00000602698 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 TEX22C9J3V5 150 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 MXD1Q05195 221 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 ATP5G2Q06055 141 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 Q8N402 240 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 NECAP1Q8NC96 275 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 OR2A7Q96R45 310 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 CITED4Q96RK1 184 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 PEMTQ9UBM1 199 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-247ENST00000602698 SPATA2Q9UM82 520 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms