RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF561Q8N587 486 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF525Q8N782 197 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 NANPQ8TBE9 248 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GV90 55 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 MARCH11A6NNE9 402 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SIAH2O43255 324 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFB7P17568 137 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 BAXQ07812 192 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ODF1Q14990 250 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 AVPI1Q5T686 147 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSX7Q7RTT5 188 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 JPT1Q9UK76 154 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 YPEL1O60688 119 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QTNF9P0C862 333 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYNX1P0DP58 116 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL3L1P16619 93 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFSF4P23510 183 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 R3HDM4Q96D70 268 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 YPEL2Q96QA6 119 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF727A8MUV8 499 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYOD1P15172 320 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 KPTNQ9Y664 436 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 DLX1P56177 255 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS2R30P59541 319 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBPJQ06330 500 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYG1Q8N1E2 194 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL21O00585 134 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 IRF2P14316 349 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 BMI1P35226 326 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 COA4Q9NYJ1 87 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 COL8A2P25067 703 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 LY6DQ14210 128 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF726P1Q15940 193 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPRMQ9NS64 109 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CTSZQ9UBR2 303 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNCP24821 2201 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM178BH3BS89 294 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB29O14966 203 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFA4P12838 97 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF383Q8NA42 475 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 DDB2Q92466 427 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNA5P01569 189 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFRSF1AP19438 455 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 MSMO1Q15800 293 aa8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.34□□□□□ -1.07
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