RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 CA2P00918 260 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OPN1MWP04001 364 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OPN1MW2P0DN77 364 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OPN1MW3P0DN78 364 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ZNF329Q86UD4 541 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PRRT1Q99946 306 aa20.57■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 HPRT1P00492 218 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ZNF735P0CB33 412 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 F2RP25116 425 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CD83Q01151 205 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PHLDA2Q53GA4 152 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TEX38Q6PEX7 206 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TPSG1Q9NRR2 321 aa20.56■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 RAMP3O60896 148 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CNIH1O95406 144 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 NDUFA11Q86Y39 141 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TRIM63Q969Q1 353 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PLEKHA2Q9HB19 425 aa20.55■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TRAV41A0A0B4J266 112 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PPP5CP53041 499 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TAS2R31P59538 309 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 FXYD3Q14802 87 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 C10orf99Q6UWK7 81 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ARPC1AQ92747 370 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 RHOVQ96L33 236 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SRRQ9GZT4 340 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SLC2A9Q9NRM0 540 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.54■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OR2A4O95047 310 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 RND3P61587 244 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 GNB1P62873 340 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 NDPQ00604 133 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ZNF45Q02386 682 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CFHR3Q02985 330 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PRSS8Q16651 343 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TBC1D26Q86UD7 250 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OR2A7Q96R45 310 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 SLC2A8Q9NY64 477 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 COMMD9Q9P000 198 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 WSB1Q9Y6I7 421 aa20.53■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ELANEP08246 267 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 NQO2P16083 231 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PJVKQ0ZLH3 352 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 FOXE3Q13461 319 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 PRR31Q5SQ13 230 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 IDO2Q6ZQW0 420 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 MMD2Q8IY49 270 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 OR51S1Q8NGJ8 323 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 MCUBQ9NWR8 336 aa20.52■□□□□ 0.88
NME3-209ENST00000566600 ACTL6BO94805 426 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 IGHG4P01861 327 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 POU2AF1Q16633 256 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 ECSCRQ19T08 205 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 OR13C8Q8NGS7 320 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 MARCH1Q8TCQ1 289 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 FBXO7Q9Y3I1 522 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.51■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 G3V318 75 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 MPPED1O15442 326 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 KBTBD11O94819 623 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 PIGPP57054 158 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 OR4A5Q8NH83 315 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 ZFP57Q9NU63 452 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 BET1LQ9NYM9 111 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 COPZ2Q9P299 210 aa20.5■□□□□ 0.87
NME3-209ENST00000566600 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms