RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	PROK2	Q9HC23	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	MED29	Q9NX70	200 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	DOK5	Q9P104	306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	COPZ2	Q9P299	210 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	SEC16A	O15027	2179 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.15	□□□□□ -1.9
LRRC28-222	ENST00000561431	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM166B	A8MTA8	275 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431		B4DXG7	233 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431		G3V2T6	193 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431		H3BQF6	201 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FCN1	O00602	326 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RGS5	O15539	181 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FKBP6	O75344	327 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SPAG7	O75391	227 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CA11	O75493	328 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM107A	O95990	144 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PTTG1	O95997	202 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	HPRT1	P00492	218 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	IGF2	P01344	180 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SPI1	P17947	270 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	MAP2K4	P45985	399 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	GALR1	P47211	349 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	OR1E2	P47887	323 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	LGALS7	P47929	136 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FABP6	P51161	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	BID	P55957	195 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	WNT4	P56705	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PMVK	Q15126	192 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	NNAT	Q16517	81 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RNF212	Q495C1	297 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	REP15	Q6BDI9	236 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	BEST4	Q8NFU0	473 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	C11orf52	Q96A22	123 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	TBX5	Q99593	518 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	PDZD2	O15018	2839 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	APC	P25054	2843 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A0U1RQV1	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	OR5H14	A6NHG9	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	C19orf84	I3L1E1	186 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CRLF1	O75462	422 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	FCGR3A	P08637	254 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	IFI6	P09912	130 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CSF3	P09919	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	TSPAN19	P0C672	248 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	LINC00032	P0C843	101 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRRC28-222	ENST00000561431	CD37	P11049	281 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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