RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TRDC	B7Z8K6	153 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	C15orf65	H3BRN8	121 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFS8	O00217	210 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	UPK1B	O75841	260 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MMP23A	O75900	390 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PMP2	P02689	132 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CSN2	P05814	226 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	FCGR3A	P08637	254 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF735	P0CB33	412 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CCL3L1	P16619	93 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GZMH	P20718	246 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	DTYMK	P23919	212 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	IL2RG	P31785	369 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	OR3A3	P47888	321 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ3	P48549	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	EDDM3B	P56851	147 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PAX5	Q02548	391 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ8	Q15842	424 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf88	Q6PI97	169 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TCF23	Q7RTU1	214 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934		Q8NBF4	154 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	BEST4	Q8NFU0	473 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	MMP26	Q9NRE1	261 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN13	Q12923	2485 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LINS1-210	ENST00000560934	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	FABP7	O15540	132 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	RAB3D	O95716	219 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV2-5	P01817	119 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	HBZ	P02008	142 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	CD74	P04233	296 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	CD3D	P04234	171 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	C4BPB	P20851	252 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	OMG	P23515	440 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	RCVRN	P35243	200 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	CBX5	P45973	191 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	IER3	P46695	156 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	DLX1	P56177	255 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	DLX6	P56179	175 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	PAX2	Q02962	417 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	HERPUD1	Q15011	391 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	HMGN3	Q15651	99 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf87	Q6PH81	154 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZS49	121 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	OR8B2	Q96RD0	313 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	REG4	Q9BYZ8	158 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	IFT46	Q9NQC8	304 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.52	□□□□□ -1.85
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85

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