RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	LINC00473	A8K010	186 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AMY2A	P04746	511 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	UCP3	P55916	312 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AP3S2	P59780	193 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	HNF4G	Q14541	408 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	BAK1	Q16611	211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	DDB2	Q92466	427 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	APOA2	P02652	100 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AMY1A	P04745	511 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	CD40LG	P29965	261 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	DEFB136	Q30KP8	78 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	BVES	Q8NE79	360 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RITA1	Q96K30	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222		H7C2Y5	167 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222		M0QZK8	103 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	IL7	P13232	177 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	P2RX4	Q99571	388 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	GPR31	O00270	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	FGF16	O43320	207 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TNFSF12	O43508	249 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RRAS	P10301	218 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PPP5C	P53041	499 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	F2RL1	P55085	397 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	NPB	Q8NG41	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RNF5	Q99942	180 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	PRRT1	Q99946	306 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	NDUFA3	O95167	84 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	PGAM2	P15259	253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	CNTFR	P26992	372 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	MMD	Q15546	238 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222		Q8N9W7	124 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	NBR2	O15453	112 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	RLN1	P04808	185 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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