RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 STUB1Q9UNE7 303 aa8.99□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.99□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GW64 132 aa8.98□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM235A6NFC5 223 aa8.98□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6V1G2O95670 118 aa8.98□□□□□ -0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 PRH1P02810 166 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 OR9G9P0C7N8 305 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 ARL6IP1Q15041 203 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.97□□□□□ -0.97
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 NECAP1Q8NC96 275 aa8.94□□□□□ -0.98
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CLSTN3-211ENST00000541667 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATA2Q9UM82 520 aa8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.93□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 H0Y980 276 aa8.93□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2J3O76001 311 aa8.93□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGNO76038 276 aa8.93□□□□□ -0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 KBTBD11O94819 623 aa8.93□□□□□ -0.98
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