RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ECI1P42126 302 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CX3CL1P78423 397 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXE3Q13461 319 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AADACL3Q5VUY0 350 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC190Q86UF4 302 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DEDD2Q8WXF8 326 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RSRP1Q9BUV0 290 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFP57Q9NU63 452 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNCP24821 2201 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 M0QYG6 137 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNFSF12O43508 249 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAB3DO95716 219 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HRASP01112 189 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKAIN1P0CW23 69 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NDPQ00604 133 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4F17Q8NGA8 305 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARPC1AQ92747 370 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4F4Q96R69 305 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COMMD9Q9P000 198 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAV41A0A0B4J266 112 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HPRT1P00492 218 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RLN1P04808 185 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGF2P09038 288 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAS2R31P59538 309 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POU2AF1Q16633 256 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKIRIN2Q53H80 203 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C19orf54Q5BKX5 351 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2B11Q5JQS5 317 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF329Q86UD4 541 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM68Q96MH6 324 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRRT1Q99946 306 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TPSG1Q9NRR2 321 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DISC1C4P0D8 188 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FCN1O00602 326 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 F2RP25116 425 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSMB8P28062 276 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPIFP30405 207 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AP3S2P59780 193 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RND3P61587 244 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRSS8Q16651 343 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MMD2Q8IY49 270 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CADM3Q8N126 398 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MINDY2Q8NBR6 621 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR51H1Q8NH63 302 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4A5Q8NH83 315 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TERB2Q8NHR7 220 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM63Q969Q1 353 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RHOVQ96L33 236 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAMP3O60896 148 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KBTBD11O94819 623 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2A4O95047 310 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TSPAN15O95858 294 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGLV1-40P01703 118 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NQO2P16083 231 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAUP35544 74 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FXYD3Q14802 87 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF79Q15937 498 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE2CQ5TA81 110 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q8N402 240 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR5M8Q8NGP6 311 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2A7Q96R45 310 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPHA2Q96T91 129 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BET1LQ9NYM9 111 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACTL6BO94805 426 aa12.86□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNIH1O95406 144 aa12.86□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF735P0CB33 412 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms