RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SCN1BQ07699 218 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ODF4Q2M2E3 257 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 Q6P435 159 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.27□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 PDPNQ86YL7 162 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LAX1Q8IWV1 398 aa3.27□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.27□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRF3 423 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRM7 423 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 MSGN1A6NI15 193 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 H0Y980 276 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ST8SIA3O43173 380 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA3O95167 84 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 MGMTP16455 207 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 TM2D1Q9BX74 207 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 Q9H521 79 aa3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 PALMDQ9NP74 551 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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HDAC2-216ENST00000523628 ING4Q9UNL4 249 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GAB2Q9UQC2 676 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.26□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0A6YYH2 397 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0B4J203 849 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.25□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM172BPA6NC97 362 aa3.25□□□□□ -1.89
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