RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	LY86	O95711	162 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	SPN	P16150	400 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	CBX5	P45973	191 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	XRCC3	O43542	346 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	AIRE	O43918	545 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	FCGR3B	O75015	233 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ZP3	P21754	424 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ARPC4	P59998	168 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	MMD2	Q8IY49	270 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	OR4S2	Q8NH73	311 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ASCL2	Q99929	193 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MATR3-222	ENST00000513678	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	GP9	P14770	177 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TNXA	Q16473	311 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SPIN2A	Q99865	258 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678		J3QRK9	145 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FCGR2C	P31995	323 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	DYRK1A	Q13627	763 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	ACTL6B	O94805	426 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	PPY	P01298	95 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	IGLV1-51	P01701	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	PHB2	Q99623	299 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KBTBD11	O94819	623 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR2A4	O95047	310 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	MAS1L	P35410	378 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TGFBR1	P36897	503 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	HRAS	P01112	189 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	NAT1	P18440	290 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KLK9	Q2XQG4	91 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	BORCS5	Q969J3	196 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	CMTM3	Q96MX0	182 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TEX22	C9J3V5	150 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	MPPED1	O15442	326 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	FGF2	P09038	288 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	PTHLH	P12272	177 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	TAS2R20	P59543	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MATR3-222	ENST00000513678	DEFA5	Q01523	94 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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