RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF134	P52741	427 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ERVK-16	P61578	105 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RNF7	Q9UBF6	113 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	C15orf62	A8K5M9	175 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CGB3	P0DN86	165 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CGB7	P0DN87	165 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RAB7A	P51149	207 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ELOB	Q15370	118 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	S1PR3	Q99500	378 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SLC25A22	Q9H936	323 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	IL19	Q9UHD0	177 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522		A8MXE2	369 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	FAM201A	Q5SY85	155 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522		Q8WTZ3	238 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SDSL	Q96GA7	329 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	GCM1	Q9NP62	436 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	GAB2	Q9UQC2	676 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	GFRA3	O60609	400 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3-7	P01780	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV2-5	P01817	119 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	NQO2	P16083	231 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CD40	P25942	277 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SSX2	Q16385	188 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	OR52E5	Q8NH55	327 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522		Q8TCH9	128 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV1-46	P01743	117 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	BMP5	P22003	454 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TNFSF4	P23510	183 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	PSMB3	P49720	205 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	STUM	Q69YW2	141 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CAD	P27708	2225 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CD81	P60033	236 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ERVFRD-1	P60508	538 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	OR4S2	Q8NH73	311 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	DDB2	Q92466	427 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CEP250	Q9BV73	2442 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	AP4M1	O00189	453 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CXCL1	P09341	107 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RELB	Q01201	579 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM140	Q9NV12	185 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		12.67	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1B0GV90	55 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CYB5B	O43169	146 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	IFNA10	P01566	189 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CD1B	P29016	333 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	LEAP2	Q969E1	77 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	GAFA1	Q96PS6	74 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM250	H0YL14	139 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	HCFC1	P51610	2035 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TLE1	Q04724	770 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	DIRC2	Q96SL1	478 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		12.65	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		12.65	□□□□□ -0.38
CALD1-222	ENST00000495522	CLDN34	H7C241	214 aa		12.65	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms