RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CD5P06127 495 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PPH5 198 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 FOXH1O75593 365 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 NPBWR1P48145 328 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SULT1A2P50226 295 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RND3P61587 244 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF585BQ52M93 769 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF14Q92956 283 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 PARP11Q9NR21 331 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CREBBPQ92793 2442 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 KCNAB3O43448 404 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MBD6Q96DN6 1003 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 C12orf57Q99622 126 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SIRPDQ9H106 197 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ACANP16112 2415 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A087X0M5 115 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GX30 115 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RAB29O14966 203 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1-39P01597 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1D-39P04432 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A16P16260 332 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR9G1Q8NH87 305 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 GALNT14Q96FL9 552 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TBX15Q96SF7 602 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 TOX4O94842 621 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MMP9P14780 707 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RAB7AP51149 207 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RAB32Q13637 225 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 BTNL8Q6UX41 500 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR10C1Q96KK4 312 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA1O95477 2261 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CR1P17927 2039 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 IGLV1-47P01700 117 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 PRTN3P24158 256 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1D1P51857 326 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 F2RL1P55085 397 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35G3Q8N808 338 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF383Q8NA42 475 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 LHX4Q969G2 390 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.067e-10■■■■□ 20.1
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 M0R1W7 72 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO24O75426 580 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 JTBO76095 146 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ARG1P05089 322 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CRYBA1P05813 215 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CT45A6P0DMU7 189 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CT45A5P0DMU8 189 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 CT45A7P0DMV0 189 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PPE2 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PR64 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PRV1 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 FCGR3BO75015 233 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MEOX2P50222 304 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 COMMD1Q8N668 190 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 HRH4Q9H3N8 390 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 A0A0G2JRQ6 117 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 H0Y980 276 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 ITGB1BP1O14713 200 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 AVPP01185 164 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-217ENST00000475693 MSMBP08118 114 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms