RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 COQ2Q96H96 371 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 CHODLQ9H9P2 273 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 M0QZK8 103 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 WNT9BO14905 357 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 SMPD2O60906 423 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 GRPP07492 148 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 STAG3L2P0CL84 134 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 STAG3L3P0CL85 134 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 OPRK1P41145 380 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 OR1C1Q15619 314 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TREML4Q6UXN2 200 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 A6NNC1 897 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 K7EN84 100 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TNFSF13O75888 250 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 SERF1AO75920 110 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TFF1P04155 84 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 CDKN1AP38936 164 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 THBS3P49746 956 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TPPP2P59282 170 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PAFAH1B2P68402 229 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 NINJ1Q92982 152 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MGST2Q99735 147 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IL17BQ9UHF5 180 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IRF2P14316 349 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 SSTR5P35346 364 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PSG7Q13046 419 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 AARDQ4LEZ3 155 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 WDR31Q8NA23 367 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PATE3B3GLJ2 98 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PRSS46E5RG02 174 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 DLEU1O43261 78 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MPDU1O75352 247 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IL36BQ9NZH7 164 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 F2Z2F3 143 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 SLC17A3O00476 420 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 CXorf1O96002 111 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 CRISP2P16562 243 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.6□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 GABRA2P47869 451 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF90Q03938 601 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MIC13Q5XKP0 118 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 C1orf159Q96HA4 380 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PSG11Q9UQ72 335 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 J3QW42 95 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 FOXF2Q12947 444 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 GABRA6Q16445 453 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.59□□□□□ -1.03
LINC00886-201ENST00000472943 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 AQP7O14520 342 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 NPSP0C0P6 89 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 COL8A2P25067 703 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 BRS3P32247 399 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 LGALS4P56470 323 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 RANP62826 216 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 GAGE1Q13065 139 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.59□□□□□ -1.04
LINC00886-201ENST00000472943 Q8TCH9 128 aa8.59□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms