RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ECI1P42126 302 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RND3P61587 244 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CATR1Q13166 79 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CBX3Q13185 183 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ASAH1Q13510 395 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RTL8BQ17RB0 113 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PDPNQ86YL7 162 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM230Q96A57 120 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 COPZ2Q9P299 210 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TNCP24821 2201 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF212BA8MTL3 300 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RAMP3O60896 148 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB6O95139 128 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV2-23P01705 113 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYBA1P05813 215 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 F2RP25116 425 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR2DS2P43631 304 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 LPAR6P43657 344 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 BLCAPP62952 87 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 MMDQ15546 238 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SP6Q3SY56 376 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM177Q53S58 311 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 Q8N9W7 124 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 POC5Q8NA72 575 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TP53RKQ96S44 253 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCC1Q96S66 551 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL15Q9H469 300 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RRHO14718 337 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NBR2O15453 112 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 S1PR2O95136 353 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TCRBP04435 133 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 AMY1AP04745 511 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RPA2P15927 270 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC6A1P30531 599 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFA1P59665 94 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFA3P59666 94 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 PSG5Q15238 335 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF585BQ52M93 769 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SSX9Q7RTT3 188 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NPBQ8NG41 125 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4S2Q8NH73 311 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 HARBI1Q96MB7 349 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF5Q99942 180 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NAA60Q9H7X0 242 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 BEX1Q9HBH7 125 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB18Q9NP72 206 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 C1RLQ9NZP8 487 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1456Q9P272 454 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT19A8MXV4 375 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 H0Y980 276 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 FCN1O00602 326 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A17O43808 307 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFA3O95167 84 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 HPRT1P00492 218 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYGBP07316 175 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AC1P0C628 307 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 SPNP16150 400 aa6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS7P47929 136 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms