RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM18P0DKX4 95 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APELAP0DMC3 54 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAS2R20P59543 309 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK10Q15131 360 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MFSD4AQ8N468 514 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR4S2Q8NH73 311 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM68Q96MH6 324 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHB2Q99623 299 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT46Q9NQC8 304 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.02□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSGN1A6NI15 193 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNFSF12O43508 249 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAMP3O60896 148 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.01□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ECI1P42126 302 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FXYD4P59646 89 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFA5Q01523 94 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSMO1Q15800 293 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C10orf55Q5SWW7 151 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COA4Q9NYJ1 87 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANAPC10Q9UM13 185 aa12□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0G2JLM5 398 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPPED1O15442 326 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTL6BO94805 426 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRI3O95415 125 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INSL3P51460 131 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM17Q86X19 198 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMD2Q8IY49 270 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRR25Q96S07 402 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EHFQ9NZC4 300 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNCP24821 2201 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2A4O95047 310 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABARAPO95166 117 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR9G9P0C7N8 305 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRSS3P35030 304 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DS2P43631 304 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RFX2P48378 723 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF429Q86V71 674 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2A7Q96R45 310 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL7A1Q02388 2944 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SULT1C2O00338 296 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HPGDSO60760 199 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAP30O75446 220 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KBTBD11O94819 623 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOA1P02647 267 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PMP2P02689 132 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAT1P18440 290 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RORCP51449 518 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HERV-K104P61576 105 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DYRK1AQ13627 763 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTF1Q16619 201 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SSX9Q7RTT3 188 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CMTM3Q96MX0 182 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPIN2AQ99865 258 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HRASP01112 189 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRH1P02810 166 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELK1P19419 428 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAS2R46P59540 309 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CATR1Q13166 79 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR107Q5VW38 600 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSM6Q6P461 480 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPX8Q8TED1 209 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MOB3AQ96BX8 217 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USMG5Q96IX5 58 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms