RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 PTTG1O95997 202 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ELANEP08246 267 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CTXN2P0C2S0 81 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR8U9P0C7N5 309 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 SPNP16150 400 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FCGR2CP31995 323 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FXYD4P59646 89 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 Q8N6K4 173 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 Q8N9W7 124 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RAX2Q96IS3 184 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PRR25Q96S07 402 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PRRT1Q99946 306 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR2D2Q9H210 308 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 M0R1X1 148 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 DIRAS3O95661 229 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CT45A6P0DMU7 189 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CT45A5P0DMU8 189 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CT45A7P0DMV0 189 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LYL1P12980 280 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 AADACP22760 399 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CNTFRP26992 372 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 HERV-K104P61576 105 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FOXE3Q13461 319 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PLGLAQ15195 96 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TRIM16LQ309B1 348 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ZMAT4Q9H898 229 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1456Q9P272 454 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR5H14A6NHG9 310 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LINC01548A6NM66 108 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ITGB1BP1O14713 200 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 NBR2O15453 112 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LY86O95711 162 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PPYP01298 95 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 APOA2P02652 100 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 VDAC1P21796 283 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RITA1Q96K30 269 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RCHY1Q96PM5 261 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ASCL2Q99929 193 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 AGMATQ9BSE5 352 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 GHITMQ9H3K2 345 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 H0YJW9 148 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB6O95139 128 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TCRBP04435 133 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 OR8U8P0C7N1 319 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PGAM2P15259 253 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LINC00205P59089 165 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PLET1Q6UQ28 207 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RNF152Q8N8N0 203 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TERB2Q8NHR7 220 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 MOB3AQ96BX8 217 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 PARP11Q9NR21 331 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TENM2Q9NT68 2774 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 TUSC2O75896 110 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RLN1P04808 185 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 MC5RP33032 325 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-210ENST00000442481 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms