RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTPRU-201ENST00000345512 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTPRU-201ENST00000345512 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.09□□□□□ -0.31
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PTPRU-201ENST00000345512 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 WNT5AP41221 380 aa13.08□□□□□ -0.32
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PTPRU-201ENST00000345512 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 LILRA1O75019 489 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 NUBP1P53384 320 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 MFAP2P55001 183 aa13.08□□□□□ -0.32
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PTPRU-201ENST00000345512 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 HARBI1Q96MB7 349 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 NGBQ9NPG2 151 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 MMD2Q8IY49 270 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 OR2V2Q96R30 315 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRU-201ENST00000345512 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
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