RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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ACTB-201ENST00000331789 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-201ENST00000331789 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.58□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GX30 115 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 TIMD4Q96H15 378 aa14.56□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 C15orf62A8K5M9 175 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 H0YJW9 148 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.56□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 TCF19Q9Y242 345 aa14.56□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 C15orf61A6NNL5 157 aa14.55□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 IGFBP2P18065 325 aa14.55□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM186Q96B77 213 aa14.55□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 APOC3P02656 99 aa14.54□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 CACNA1BQ00975 2339 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 SNCAP37840 140 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 CLCC1Q96S66 551 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 A6NNC1 897 aa14.53□□□□□ -0.08
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