RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 RNF5Q99942 180 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1456Q9P272 454 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 GPR132Q9UNW8 380 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 VSIG4Q9Y279 399 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MPPED1O15442 326 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DRB1P01911 266 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RRASP10301 218 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 BTCP35070 178 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LGALS7P47929 136 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 AP3S2P59780 193 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CX3CL1P78423 397 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IFITM3Q01628 133 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CATR1Q13166 79 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SP6Q3SY56 376 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TP53RKQ96S44 253 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PRRT1Q99946 306 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ATP6V0E1O15342 81 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CA2P00918 260 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1-39P01597 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1D-39P04432 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MYOD1P15172 320 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LPAR6P43657 344 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C3orf56Q8N813 242 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 BORCS5Q969J3 196 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM230Q96A57 120 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RHOVQ96L33 236 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GUS0 222 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 G3V318 75 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 34.6
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PDE4D-201ENST00000309641 CD40LGP29965 261 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 RND3P61587 244 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 GNB1P62873 340 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CBX3Q13185 183 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 S100ZQ8WXG8 99 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR51J1Q9H342 316 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PARP11Q9NR21 331 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC32Q9BV29 185 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF747Q9BV97 191 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 COPZ2Q9P299 210 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 AP4M1O00189 453 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF846Q147U1 533 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-201ENST00000309641 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS8Q16651 343 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 TEX45Q8NA69 505 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 R3HDM4Q96D70 268 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 CITED1Q99966 193 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-201ENST00000309641 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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